以前も似たようなネタを書いていたのですが
たまにこの手の検索で来られる方もおられるのでメモメモ。
Windows Vista / 7 での WAMP 開発環境構築時に
インストールするフォルダに気を付けてください。
ProgramFiles にインストールすると
環境ファイルの変更をしても実際には反映されません。
細かいことは省きますが、
セキュリティの関係で ProgramFiles の中のファイルは
変更が保存されないようです。
標準でインストールしてしまうと
どうしてもここに入りますので、
必ずカスタムインストール等を利用し、
Apache なら httpd フォルダ、
MySQL なら MySQL フォルダ等、
わかりやすい場所にインストールしてください。
develop 等のフォルダを作りまとめるのも一つの方法です。
個人的には XAMPP 使ってないのでわかりませんが、
ひょっとすると同様のことがあるかもしれません。