久しぶりに Thunderbird の設定をすると、
アカウント毎に受信フォルダができていることに
違和感を感じてしまいます。
WindowsLive メールなんかもそうですから
最近のトレンドはそうなのかもしれませんが…。
ただ、メールをまとめて管理したい場合は
かなり不便ですのでまとめる方法について。
『ツール』→『アカウント設定』でアカウント設定ウィンドウを開き、
各アカウントの『サーバ設定』を選択し、右下の『詳細』ボタンをクリック。
出て来たアカウントの詳細設定ウィンドウで
『共通受信トレイ（ローカルフォルダアカウント）』を選択し
『 OK 』ボタンで閉じていきます。
こうすることで共通のメッセージフィルタを利用することもでき、
メールの振り分けが楽になるかと思います。